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System-level characterization of RNA-binding proteins that mediate the pathogenicity of human RNA viruses

Research Project
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01.05.2021
 - 30.04.2025

Obwohl das Auftreten von antibiotikaresistenten Bakterien Anlass zu grosser Sorge gibt, hat die anhaltende Pandemie die Tatsache unterstrichen, dass Viren, insbesondere solche mit einem RNA-Genom, eine gleichwertige und allgegenwärtige Bedrohung für die menschliche Gesundheit und das Leben darstellen. Es wird auch häufig vermutet, dass chronische Virusinfektionen zu Krebs führen. Zum Beispiel wurde das Hepatitis-C-Virus mit Leberkrebs in Verbindung gebracht. Wie die Langzeitpersistenz des Virus im Wirt entsteht, ist daher eine Frage von grossem Interesse. Die Interaktion zwischen Viren und Wirtszellen ist äusserst komplex und es wurde viel Arbeit geleistet, um festzustellen, wie Viren verschiedene Komponenten von Wirtszellen ausbeuten, um ihre Replikation und / oder Persistenz zu fördern. Studien in den letzten Jahren haben gezeigt, dass viele Proteine RNA-Moleküle binden, sowie neue Wechselwirkungen zwischen RNA-bindenden Proteinen und Viren entdeckt. Was jedoch immer noch schlecht charakterisiert ist, ist die Bedeutung dieser Wechselwirkungen für die Wirtszellen. Beispielsweise könnte die Bindung eines Proteins an die Virus-RNA zu einer gestörten Lokalisierung des Proteins innerhalb der Zelle oder zum "Abfangen" des Proteins von Wirts-RNAs führen, was Konsequenzen für die Funktion der Wirtszelle hat. In diesem Projekt schlagen wir einen "System" -Ansatz vor, um zu bestimmen, wie sich das Netzwerk aus viraler RNA, und Proteinen und RNAs der Wirtszelle, während der frühen Infektionsphase mit zwei verschiedenen RNA-Viren ändert, dem Hepatitis C-Virus (HCV) einerseits und dem Coxsackie B3-Virus (CVB3) andererseits. Obwohl einige der mit dem Virus interagierenden Proteine bei beiden Viren dieselben sind, unterscheidet sich die Infektionsdynamik zwischen diesen beiden Viren, wobei HCV eine chronische Infektion verursacht, während CVB3 eine lytische Infektion verursacht. Durch die Gegenüberstellung dieser beiden Modellsysteme verbessern wir das derzeitige Verständnis, wie Wirtszellen umgebaut werden, um eine Umgebung bereitzustellen, in der das Virus fortbestehen kann. Da gezeigt wurde, dass RNA-bindende Proteine eine Schlüsselrolle bei Virusinfektionen spielen, wird unsere Studie neue Ansätze für die antivirale Therapie und zur Begrenzung der Langzeitpersistenz von Viren in Wirtszellen liefern.

Collaborations & Cooperations

2025 - Participation or Organization of Collaborations on an international level
Das, Saumitra, Department of Microbiology and Cell Biology, Indian Institute of Science, Research cooperation

Funding

System-level characterization of RNA-binding proteins that mediate the pathogenicity of human RNA viruse

SNF Projekt (GrantsTool), 06.2021-05.2025 (48)
PI : Zavolan, Mihaela.

Members (3)

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Mihaela Zavolan

Principal Investigator
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Nitish Mittal

Project Member
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Maciej Smialek

Project Member